Секвенирование экзома у сотен тысяч человек может позволить идентифицировать редкие генетические варианты, кодирующие белок, связанные с защитой от заболеваний, таких как цирроз печени, обеспечивая стратегию для открытия новых терапевтических мишеней.
Исследователями было выполнено многоэтапное секвенирование экзома и анализ генетической ассоциации, чтобы идентифицировать гены, в которых редкие варианты, кодирующие белок, были связаны с фенотипами печени. В многоэтапном анализе приняли участие 542 904 человека с доступными данными об уровне печеночных аминотрансфераз, 24 944 пациента с различными типами заболеваний печени и 490 636 человек в контрольной группе без заболеваний печени. Ученые обнаружили, что редкие варианты кодирования в APOB , ABCB4 , SLC30A10 и TM6SF2 были связаны с повышенным уровнем аминотрансфераз и повышенным риском заболевания печени. Варианты в CIDEB , кодирующем структурный белок, обнаруженный в липидных каплях печени, обладают защитным эффектом.
Риски редких предсказанных вариантов потери функции плюс варианты миссенс в CIDEB(комбинированная частота носительства, 0,7%) была связана со сниженными уровнями аланинаминотрансферазы. Редкие варианты кодирования в CIDEB были связаны со сниженным риском заболевания печени по разным основным причинам и разной степени тяжести, включая цирроз любой этиологии (отношение шансов на аллель, 0,50; 95% ДИ, 0,36–0,70). Среди 3599 пациентов, перенесших бариатрическую операцию, были обнаружены редкие варианты кодирования в CIDEB, прослеживалась связь со снижением показателя активности неалкогольной жировой болезни печени.
Меню
