Ученые из Университета штата Аризона представили новый метод исследования микробиома, известный как операционные геномные единицы (OGU).
OGU объединили сильные стороны двух ранее использовавшихся методов (16S и метагеномного секвенирования). В частности, метагеномика позволяет исследователям секвенировать всю информацию о ДНК, присутствующую в образце микробиома.
OGU устраняет несовершенную практику присвоения таксономических категорий, таких как род и вид, множеству микроорганизмов, присутствующих в образце. Вместо этого, метод использует отдельные геномы в качестве основных единиц статистического анализа и просто пытается сопоставить последовательности, присутствующие в образце, с последовательностями, найденными в существующих геномных базах данных. Исследователи опубликовали свою работу в mSystems.
Источник: https://www.sciencedaily.com/releases/2022/04/220404185543.htm
