«Посредством серии крупномасштабных компьютерных симуляций, сравнивающих SARS-CoV-1 и 2, мы обнаружили, что они на самом деле очень разные. И это не просто разница в строении части белка, которая связывается с человеческим рецептором, это «весь белок», — отметил доктор Махмуд Моради из Университета Арканзаса в Фейетвилле в телефонном интервью агентству Reuters Health.
Он представил свое исследование 25 февраля на виртуальном ежегодном собрании Биофизического общества.
Первый шаг к заражению коронавирусом — проникновение вируса в клетки. Чтобы это произошло, белки-шипы на внешней стороне коронавируса должны переместиться. Хотя положение «неактивного» и «активного» состояний белков спайков как SARS-CoV-1, так и SARS-CoV-2 известно, команда доктора Моради хотела изучить, как S -протеин перемещается из одного положения в другое.
«В ходе компьютерных моделирований мы обнаружили, что SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 имеют совершенно разные способы изменения своей формы и в разных временных масштабах. SARS-CoV-1 движется быстрее, он активируется и деактивируется, и не имеет длительной возможности прикрепиться к клетке человека, потому что он не так стабилен. SARS-CoV-2, с другой стороны, стабилен и готов к атаке », — объясняет доктор Моради в заявлении на конференции.
«Активное состояние SARS-CoV-2 более длительно, чем активное состояние SARS-CoV-1, что дает ему больше шансов на связывание с рецепторами клеток человека», — сказал он Reuters Health.
Команда также определила конкретную область на конце белка-шипа, называемую N-концевым доменом (NTD), что является ключевым различием между SARS-CoV-1 и -2. «Это часть белка, на которую раньше не все обращали внимание, но оказалось, что это очень важная часть для стабильности белка», — сказал доктор Моради. Он отметил, что мутации в этом регионе могут повлиять на распростанение коронавирусной инфекции.
Возможно, удастся разработать терапевтические средства, которые изменят динамические особенности S -протеина и сделают неактивное состояние более длительным, тем самым способствуя деактивации SARS-CoV-2. Это стратегия, которая еще не была принят », — сказал Моради в пресс-релизе. .
Его команда начала изучать новый штамм SARS-CoV-2 B.1.1.7 в лаборатории, чтобы обнаружить различия в его движениях.
