В исследовании, проведенном исследовательской группой REIMAGINE, была предпринята попытка определить СИБР с помощью посева и секвенирования образцов тонкой кишки с целью выявления конкретных микроорганизмов, способствующих развитию желудочно-кишечных симптомов, у 500 пациентов, прошедших эзофагогастродуоденоскопию. Решающее значение имели три вида бактерий: кишечная палочка (E. coli), клебсиелла пневмония (Klebsiella pneumoniae) и клебсиелла аэрогенная (Klebsiella aerogenes)». У пациентов с концентрацией не менее 10³ КОЕ/мл наблюдалось усиление микробных метаболических путей, отвечающих за ферментацию углеводов, производство водорода и сероводорода, что коррелировало с симптомами. Также у этих пациентов постепенно снижалась связность микробной сети, что было обусловлено увеличением относительной численности Escherichia иKlebsiella. Исследование показало, что количество продуцентов сероводорода в двенадцатиперстной кишке хорошо коррелирует с количеством сероводорода, определяемым при тестировании дыхательного содержимого. Несмотря на явные доказательства того, что микробиом тонкой кишки играет роль в патофизиологии СРК, распространенность СИБР у пациентов с СРК сильно различается в зависимости от метода исследования. Авторы исследования выступали за ограничение использования неточных методов диагностики, подчеркивая важность дальнейшего изучения, сотрудничества, отказа от спорных догм, чтобы найти ответы на вопросы диагностики СИБР.
